SMA Negeri 1 Lepar Pongok selanjutnya disebut SMAN 1 Lepar Pongok, berdiri pada tahun 2005. Pada awal pendirian, SMAN 1 Lepar Pongok merupakan bagian dari SMAN 1 Toboali dengan status pendirian sebagai sekolah filial. Perubahan status menjadi sekolah defenitif atau berdiri sendiri pada Tahun 2009.
Sampai saat ini, SMAN 1 Lepar Pongok sudah mengalami 5 kali pergantian kepala sekolah. Bapak Arifin Burhan, S.Pd. adalah kepala sekolah pertama berstatus sebagai koordinator pendirian sekolah. Selanjutnya, Kepala sekolah dipegang oleh Bapak Muzakkir, S.Ag. Kepala sekolah ketiga adalah Bapak Zahlul Bahar. Masa kerja kepala sekolah ketiga ini merupakan masa tersingkat, hanya selama 1 tahun 6 bulan. Periode selanjutnya, Kepala sekolah kemnudian digantikan kembali kepada Bapak Muzakkir, S.Ag sampai tahun 2019.
Sejak Maret 2019, Kepala sekolah dipegang oleh Bapak Jasman, S.Pd. Hingga saat ini, kepemimpinan Bapak Jasman di SMAN 1 Lepar Pongok sudah berjalan 5 tahun. Secara resmi Bapak Jasman, S.Pd. menjabat sebagai Kepala SMAN 1 Lepar Pongok sejak tanggal 4 Maret 2019 oleh Wakil Gubernur Abdul Fatah atas nama Gubernur Provinsi Kep. Bangka Belitung.